分子对接（Molecular docking）是一种计算化学方法，用于模拟分子之间的结合和相互作用。它被广泛应用于药物发现、生物化学研究和蛋白质-配体结合等领域。
分子对接的主要目的是预测一个小分子（即“配体”）与一个大分子（即“靶标”）的结合方式，以及在这种结合方式下它们之间的相互作用。这种方法通过计算配体和靶标之间的相对自由能来评估它们之间的亲和性。在药物发现过程中，分子对接可以帮助研究人员筛选出潜在的药物候选物，并预测它们与目标蛋白质的结合方式和亲和性。
分子对接通常依赖于计算机模拟技术，包括分子动力学模拟、量子计算化学和分子模型等方法，因此需要一定的计算机科学和化学基础知识。
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