基于结构的药物设计的思路是什么样的？
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发布时间：2022-04-21 07:22
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热心网友
时间：2022-06-18 16:38
基于配体的药物分子设计，既可以用于药物虚拟筛选，也可以用于反向寻靶，譬如药物筛选管理系统（DSMS），基于二维或三维相似度等手段，进行虚拟筛选；又譬如药物靶点预测系统（DTPS），基于相似度进行靶点预测。
受体在药理学上是指糖蛋白或脂蛋白构成的生物大分子,存在于细胞膜、胞浆或细胞核内。不同的受体有特异的结构和构型。配体指对受体具有识别能力并能与之结合的物质，也就是指药。
基于配体的药物分子设计，既可以用于药物虚拟筛选，也可以用于反向寻靶，譬如药物筛选管理系统，基于二维或三维相似度等手段，进行虚拟筛选；又譬如药物靶点预测系统，基于相似度进行靶点预测。
扩展资料：
从配体和受体的三维结构出发，以分子识别为基础，借助相关计算机软件，根据构效关系直接设计药物(根据受体的三维结构)和间接设计药物(参考配体理化性质和药效基团模型)的方法。能直观地进行合理药物设计，引导先导物发现并走向理性化。包括基于配体的药物设计和基于受体的药物设计。
参考资料来源：百度百科-基于结构的药物设计
热心网友
时间：2022-06-18 16:39
基于配体的药物分子设计，既可以用于药物虚拟筛选，也可以用于反向寻靶，譬如药物筛选管理系统（DSMS），基于二维或三维相似度等手段，进行虚拟筛选；又譬如药物靶点预测系统（DTPS），基于相似度进行靶点预测。
热心网友
时间：2022-06-18 16:39
不过这些如果有心的话，还是还是有机会”“使用的。当然包也有一些的，比如openeye就很不错，除了没有效团和从头设计，其他的模块都有了，还有ArgusLab、Triton、VEGA ZZ，虽然小，但是也很精悍。再有就是一些功能单一的，很多都是的，建议你多利用这一部分的，包括：蛋白质－配体分子对接及虚拟筛选工具：Dock6.0、AutoDock、eHiTS蛋白质－蛋白质对接工具: HADDOCK、ESCHER、MONTY、ZDOCK、hex、BIGGER分子动力学工具：Gromacs、NAMD效团模型工具：3DFS同源模建工具：ModellerDNA三维结构构建：3DNA分子文件格式转化工具：Babel、OpenBabel图形显示工具：Chimera、Vida、ICM browser、DeepView、Rasmol、VMD量子化学工具：Mopac、Dalton、amsol很多功能单一但是很经典都让我爱不释手，不过都是商业的，比如gold、grid（最近刚开始收费），vorsurf，corina，mvd，ligandscout等。你可以试试
